Крупномасштабная структура хроматина

На сегодняшний момент в поисках универсальных принципов крупномасштабной организации хроматина мы исследовали методами малоуглового рассеяния нейтронов (МУРН) два типа ядер: ядра куриных эритроцитов и ядра HeLa. Оба типа клеток демонстрируют двухуровневую фрактальную организацию хроматина. Мелкомасштабная фрактальная организация описывается классической моделью однородного фрактала, который повторяет свое геометрическое строение на разных масштабах, с дробной размерностью равной приблизительно 2.5. Мелкомасштабная фрактальная организация построена так, чтобы максимально облегчить диффузию белков. Крупномасштабная фрактальная организация описывается моделью логарифмического фрактала, которая была специально разработана в рамках данного исследования. Корреляционная функция такого фрактала описывается не степенной функцией, как в случае оббъемного фрактала, а логарифмической. Это приводит к необычным масштабным свойством, а именно, уменьшение масштаба в N раз дает аддитивную добавку к корреляционной функции, что отличает его от классического однородного фрактала (D_H имеет одно значение во всех его областях), характеризующегося мультипликативной добавкой. В результате логарифмический фрактал является более компактным, чем объемный фрактал, но он все еще имеет довольно большую площадь поверхности, что обеспечивает высокую доступность внешних агентов на всех масштабах длины. Эти два свойства (доступность и компактность) крупномасштабной структуры хроматина облегчают не только диффузию белков, но и взаимодействие генов.